澎湖馬公一家養雞場十一月十九日發生雞隻大量死亡，
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，昨天確認為今年來第七例高病原性（可能造成大量死亡）Ｈ５Ｎ２禽流感，
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，是澎湖首例禽流感。農委會防檢局表示，
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，該養雞場的雞隻已在上月廿二日全數撲殺並完成消毒，
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，之後三個月會持續監測半徑三公里內的三家養雞場。
防檢局表示，
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，分析這次禽流感的病毒序列，
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，發現有三個鹼性胺基酸，
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，但一般高病原禽流感通常有四個胺基酸；台大獸醫學院名譽教授賴秀穗建議比對核酸序列，
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，確認是不是新的病毒株。
中研院院士賴明詔則指出，Ｈ５Ｎ２一般都是低病原性，但台灣這幾個月陸續出現病原性較高的Ｈ５Ｎ２，代表病毒可能突變、毒性變得更強。他建議與禽鳥接觸的人施打流感預防針，避免人流感病毒與禽流感病毒在人體內基因交換，發展出新型人流感病毒，在人類間相互傳染。
防檢局副局長黃國青表示，調查推測這次爆發禽流感的雞是來自嘉義。十一月十四日，澎湖養雞業者託人在嘉義的雞隻集貨場買了一百多隻雞，十九日業者的養雞場內就有一百五十隻雞死亡，當天就懷疑是禽流感、通報澎湖家畜疾病防治所抽檢；隔天養雞場又有五十隻雞死亡。
廿二日初步確認是Ｈ５Ｎ２禽流感，澎湖縣政府就自發撲滅養雞場中剩下的六百卅一隻雞。至昨天檢測結果出爐，確認是高病原性禽流感。
黃國青說，回去找嘉義的養雞場時，雞都已賣光了，「已盡最大力量找」，但可能沒辦法追到有問題雞隻來源。呼籲雞農別買來源不明的雞，並做好消毒。
賴秀穗說，一般判斷高病原或低病原，有現場雞隻是否有病原症狀、實驗室分析病毒序列、及替雞隻靜脈內接種的致病性指數（IVPI）三個指標。IVPI指數一‧二以上是高病原；病毒若有三個或三個以上鹼基，也須懷疑是否是高病原。
根據防檢局數據，這次的禽流感病毒有三個鹼基、IVPI指數一‧七八。賴秀穗說，三個鹼基的高病原性Ｈ５Ｎ２禽流感病毒較少見，建議檢測單位比對核酸序列，確認與過去彰化、苑裡地區的禽流感病毒是否為同一株。，