國防部一名不願具名法律事務司軍法官表示，
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，軍方調查小組確實發現洪仲丘案有部分錄影監視畫面消失，
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，已查扣電腦主機，
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，交法務部調查局還原，
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，並追查是否「人為湮滅」。
這名軍法官表示，
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，法務部調查局有能力分析並救回被刪除的畫面，且有能力查出是人為刪除或機器故障；如果是人為刪除，會追究湮滅罪證的刑事責任。
軍法官說，七月三日洪仲丘暴斃當天，家屬就提出質疑，軍事檢察官即調閱禁閉室內外錄影畫面，調閱的日期從洪進入禁閉室開始，發現七月一日有一段畫面不見，檢察官當場查扣電腦主機，上周送交調查局還原。
軍法官指出，軍事檢察官已蒐集洪仲丘關禁閉期間，每天天氣資料及每天操練科目，釐清涉案軍士官是蓄意或過失致死責任。
對於退役少尉軍醫呂孟穎遭陸軍司令部函請軍事檢察署調查，外界質疑軍方意圖找代罪羔羊，國防部表示，洪案發生後，社會上有不少人質疑呂姓軍醫在搶救過程也有過失，包括延誤到場、隨車送醫途中未攜氧氣瓶等，陸軍司令部基於社會有疑慮，才決定將呂函請軍檢署調查。
國防部說，調查結果如確認呂在洪案中有責任，就依法追究責任；若呂沒有任何疏失，也好還呂清白。，